Es gibt keine fixen Einreichungstermine. Nach der Ersteingabe erhalten Gesuchsteller und Sponsor im cc eine Eingangsbestätigung per E-Mail. Nachzureichende Dokumente werden durch das wissenschaftliche Sekretariat angefordert. Das Gesuch wird anschliessend intern zur Begutachtung weitergeleitet. Die Gesuche werden chronologisch nach Eingang, jedoch erst, wenn die Unterlagen vollständig sind, dem nächstmöglichen, freien Sitzungstermin zugeordnet. Verfahren und Fristen für die Begutachtung sind in den neuen Verordnungen festgehalten, für klinische Versuche in Art. 26 und 27 KlinV, für nicht-klinische Versuche in Art. 16 und 17 HFV.
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